Para el impulso de actuaciones y proyectos de eficiencia energética y energías renovables, el IDAE tiene  entre sus funciones la financiación de proyectos  y el desarrollo y gestión de programas de ayudas públicas que afectan a los principales sectores consumidores de energía.

Además, para el período 2014-2020, el IDAE desarrolla la labor de organismo intermedio para la gestión de Fondos FEDER dedicados a la economía baja en carbono, dentro del Programa Operativo de Crecimiento Sostenible.

Los orígenes de los recursos gestionados por el IDAE provienen, fundamentalmente, de Fondos FEDER, Fondo Nacional de Eficiencia Energética, Presupuestos Generales del Estado y de la financiación propia del Instituto.